Le juge Gérard Niyungeko est un ressortissant du Burundi. Il a été élu juge de la Cour africaine des droits de l'homme et des peuples en 2006 pour un mandat de six ans (renouvelable une seule fois). Il a été le premier Président de la Cour (2006-2008). Il a été réélu pour le deuxième mandat en tant que Président de la Cour africaine pour la période 2010-2012.
Le juge Gérard Niyungeko est titulaire d'un doctorat en droit de l'Université de Bruxelles (1988) et professeur de droit international, de droit constitutionnel et de droit des droits de l'homme à l'Université du Burundi.
Il est également titulaire d'une licence en droit de l'Université du Burundi (1979), d'une maîtrise en droit international de l'Université de Bruxelles (1983) et du diplôme de l'Académie de droit international de La Haye (1984).
Il a été professeur invité aux cours d'été de droit international humanitaire de Dijon (France, septembre 1992) et de Nottwill (Suisse, septembre 1994), à l'Université de Bruxelles (2002-2003), à l'Académie de droit international de La Haye (juillet-août 2007), à l'Université d'Ottawa (janvier 2009) et à l'Institut international des droits de l'homme (Strasbourg, France, juillet 2010). De 1999 à 2003, le juge Gérard Niyungeko a été titulaire de la Chaire UNESCO d'éducation à la paix et à la résolution des conflits à l'Université du Burundi.
Il a été vice-recteur de l'Université du Burundi (1997-2000) ; président de la Commission constitutionnelle du Burundi (1991-1992) ; président de la Cour constitutionnelle du Burundi (1992-1996) ; membre du Tribunal de la Zone d'échanges préférentiels des pays d'Afrique orientale et australe (ZEP) (1991-1996) ; Conseil devant le Tribunal arbitral international (Bruxelles, 1991-1992) et devant la Cour internationale de justice (1999-2001 et 2002-2005) ; Consultant au sein du système des Nations unies (2001 et 2002) et de la Commission de l'Union africaine (2005-2006). Il est actuellement membre du panel d'arbitres du Centre international pour le règlement des différends relatifs aux investissements (CIRDI).
Il est l'auteur de plusieurs ouvrages, dont les suivants : Les droits de l'homme, cours destiné aux formateurs, Bujumbura, 1994, 92 p. ; La preuve devant les juridictions internationales, Bruxelles, Bruylant, 2005, 480 p.